29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2401 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  100 
 
 
385 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  76.1 
 
 
387 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  76.1 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  54.48 
 
 
393 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  47.61 
 
 
366 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  45.74 
 
 
370 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  47.38 
 
 
363 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  51.42 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  41.81 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  43.02 
 
 
367 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  42.55 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  34.59 
 
 
362 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  27.47 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  24.25 
 
 
409 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  21.05 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  21.05 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  21.05 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  21.37 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  20.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  29.36 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  20.61 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  25.06 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  25.51 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  25.82 
 
 
831 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  25.93 
 
 
410 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  24.09 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  26 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  21.51 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  20.76 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>