26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4573 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  100 
 
 		 366 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  73.35 
 
 		 363 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  49.57 
 
 		 369 aa  301  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  47.34 
 
 		 387 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  46.94 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  43.6 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  44.5 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  47.61 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  49.86 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  47.41 
 
 		 363 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  45.2 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  33.51 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  23.26 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  23.26 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  23.26 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  22.63 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  34.13 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  23.65 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  29.49 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  26.57 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  24.28 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  24.62 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  29.69 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  21.01 
 
 		 603 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  21.01 
 
 		 603 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  22.9 
 
 		 607 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>