13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5485 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5485  acyltransferase 3  100 
 
 
394 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15660  predicted acyltransferase  39.83 
 
 
361 aa  202  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25770  hypothetical protein  39.51 
 
 
306 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25760  predicted acyltransferase  34.15 
 
 
369 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  31.4 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  24.62 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  26.37 
 
 
378 aa  53.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  25.65 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  27.27 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  24.93 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  22.47 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  25.86 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  28.25 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>