28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1542 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  100 
 
 		 370 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.67 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1185  acyltransferase 3  24.33 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5002  acyltransferase family protein  27.08 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3580  hypothetical protein  43.37 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  26.07 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1666  acyltransferase 3  25.78 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  25.88 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  28.41 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  37.37 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  24.23 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  26.94 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  33.09 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  34.95 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  37.25 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  31.4 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3104  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2081  putative acyltransferase  23.23 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00181822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  31.69 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1175  acyltransferase 3  30.54 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.26 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  26.22 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>