249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3168 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  100 
 
 		 585 aa  1109    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  65.82 
 
 		 588 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  62.82 
 
 		 588 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  67.46 
 
 		 587 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  31.23 
 
 		 623 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.66 
 
 		 611 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  33.05 
 
 		 727 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  29.66 
 
 		 622 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  38.04 
 
 		 623 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 613 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  36.81 
 
 		 623 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  33.81 
 
 		 626 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  35.48 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 		 704 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  33.03 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  29.85 
 
 		 713 aa  156  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  36.93 
 
 		 503 aa  146  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 		 588 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  29.46 
 
 		 618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  32.8 
 
 		 496 aa  132  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 		 487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 		 623 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  23.83 
 
 		 623 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 		 632 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  32.29 
 
 		 632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  31.19 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 		 632 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 		 486 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 		 566 aa  113  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 		 623 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  23.95 
 
 		 617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 477 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 		 627 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  21.68 
 
 		 637 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  26.56 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 		 485 aa  104  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  28.06 
 
 		 599 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  23.89 
 
 		 614 aa  103  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.61 
 
 		 477 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.37 
 
 		 847 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.76 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.74 
 
 		 644 aa  97.8  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 472 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.03 
 
 		 642 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 858 aa  97.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.04 
 
 		 482 aa  97.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 858 aa  97.1  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  23.33 
 
 		 623 aa  96.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 		 640 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  24.13 
 
 		 609 aa  94.7  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 		 657 aa  93.6  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.94 
 
 		 683 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.16 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 		 818 aa  92.8  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 		 457 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  24.68 
 
 		 920 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.51 
 
 		 653 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 		 608 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  23.43 
 
 		 608 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  25.65 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  24.67 
 
 		 480 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  22.93 
 
 		 846 aa  87.8  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  25.59 
 
 		 458 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 454 aa  87  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  25.19 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  23.11 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 642 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>