137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1390 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  78.98 
 
 
295 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  78.64 
 
 
295 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  79.32 
 
 
295 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  77.63 
 
 
295 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  77.29 
 
 
295 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  80 
 
 
295 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  60.84 
 
 
295 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  61.17 
 
 
298 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  59.45 
 
 
298 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  58.59 
 
 
321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  59.09 
 
 
296 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  60.44 
 
 
298 aa  334  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  58.74 
 
 
296 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  58.36 
 
 
293 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  53.92 
 
 
312 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  56.06 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  54.51 
 
 
298 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  55.39 
 
 
293 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  55.02 
 
 
293 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  51.61 
 
 
296 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  51.6 
 
 
296 aa  299  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  51.6 
 
 
296 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  54.95 
 
 
340 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  51.99 
 
 
296 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  48.21 
 
 
310 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  48.21 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  46.44 
 
 
319 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  44.53 
 
 
293 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  41.55 
 
 
286 aa  225  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 
287 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  45.04 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 
287 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  38.13 
 
 
285 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  39.19 
 
 
286 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  39.19 
 
 
286 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  39.13 
 
 
286 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  36.97 
 
 
296 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  37.32 
 
 
290 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 
286 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  39.18 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  38.01 
 
 
310 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  39.34 
 
 
312 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  38.6 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  37.74 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  37.64 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  33.09 
 
 
285 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  34.48 
 
 
292 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 
297 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 
297 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  37.68 
 
 
301 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  35.9 
 
 
289 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  38.97 
 
 
290 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  34.31 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  33.94 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  35.66 
 
 
302 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  35.66 
 
 
302 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  35.66 
 
 
302 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  35.66 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.66 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.66 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  31.8 
 
 
302 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  33.87 
 
 
291 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.37 
 
 
258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  31.93 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 
263 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 
268 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  31.33 
 
 
266 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 
267 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  31.36 
 
 
266 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  31.4 
 
 
266 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  31.36 
 
 
273 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  31.89 
 
 
267 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  31.36 
 
 
266 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 
270 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  31.44 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  32.03 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.56 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  29.34 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.2 
 
 
266 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  28.03 
 
 
266 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  27.17 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  31.09 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  26.78 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  31.73 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  29.46 
 
 
262 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  32.08 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  30.31 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  29.73 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 
267 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  31.56 
 
 
270 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>