More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
288 aa  554  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  79.17 
 
 
288 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  78.12 
 
 
288 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  78.12 
 
 
311 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.65 
 
 
287 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.6 
 
 
287 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.65 
 
 
287 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.6 
 
 
287 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  81.25 
 
 
288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  74.91 
 
 
292 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.07 
 
 
292 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.76 
 
 
300 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.61 
 
 
292 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  71.83 
 
 
292 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.9 
 
 
295 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.9 
 
 
295 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.55 
 
 
295 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  70.42 
 
 
292 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.53 
 
 
288 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.18 
 
 
290 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.83 
 
 
288 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.79 
 
 
295 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.06 
 
 
295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  70.42 
 
 
578 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  59.72 
 
 
288 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.4 
 
 
288 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.26 
 
 
308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.78 
 
 
298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.78 
 
 
298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  63.77 
 
 
298 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.45 
 
 
289 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  57.25 
 
 
289 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.92 
 
 
292 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  58.92 
 
 
323 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  58.6 
 
 
323 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.5 
 
 
292 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  58.6 
 
 
323 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  66.93 
 
 
313 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  66.93 
 
 
313 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  66.93 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  61.96 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
288 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58.54 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.54 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  58.49 
 
 
287 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.53 
 
 
294 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  67.92 
 
 
239 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.91 
 
 
296 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  85.43 
 
 
187 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.2 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 
270 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.58 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.63 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
245 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  35.81 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
254 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.82 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.74 
 
 
252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
254 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
294 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
259 aa  105  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
319 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
345 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
264 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
254 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
291 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  32.33 
 
 
264 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1340  aliphatic sulfonate ABC transporter transmembrane protein  35.14 
 
 
264 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0574559  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
264 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
263 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
281 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
289 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 
241 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
321 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  33.47 
 
 
272 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
268 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
264 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
273 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.8 
 
 
279 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
273 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
273 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
273 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
273 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
269 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
253 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
253 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
253 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
264 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 
269 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.6 
 
 
270 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.84 
 
 
260 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>