More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22350  sigma54-dependent activator protein  100 
 
 
343 aa  673    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43900  Sigma54-dependent transcriptional activator protein  53.85 
 
 
367 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0564  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.45 
 
 
391 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0556  response regulator receiver protein  52.2 
 
 
367 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  55.49 
 
 
366 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332569  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2771  sigma-54 dependent transcriptional regulator  53.75 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2982  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.45 
 
 
367 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165911  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3918  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.63 
 
 
367 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34210  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 
376 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0247085  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5791  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.78 
 
 
375 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6156  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.78 
 
 
375 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164312  normal  0.688082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2908  putative transcriptional regulator  53.61 
 
 
376 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7716  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.78 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.416499  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1567  sigma-54 factor, interaction region  49.58 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0116194  hitchhiker  0.0000311693 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6033  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.15 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3328  response regulator receiver protein  51.35 
 
 
352 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0881  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.92 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.588109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3248  helix-turn-helix, Fis-type  51.75 
 
 
368 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34150  putative transcriptional regulator  51.65 
 
 
361 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.093709  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2903  putative transcriptional regulator  51.65 
 
 
361 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5803  putative sigma54 specific transcriptional regulator  53.31 
 
 
376 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6636  putative sigma54 specific transcriptional regulator  53.78 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3467  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  51.46 
 
 
368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6136  putative sigma54 specific transcriptional regulator  54.65 
 
 
389 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0424882  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2612  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.56 
 
 
372 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3526  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.44 
 
 
377 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3993  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49.85 
 
 
375 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  0.104831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1472  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.62 
 
 
451 aa  291  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  46.43 
 
 
687 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1972  response regulator receiver protein  48.48 
 
 
455 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1016  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.47 
 
 
455 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.963955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.95 
 
 
495 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.98 
 
 
453 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0540  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.72 
 
 
445 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1248  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.88 
 
 
373 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.81595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.25 
 
 
486 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5223  putative sigma54 specific transcriptional regulator  55.6 
 
 
276 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5217  sigma-54-binding protein  52.53 
 
 
316 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.06 
 
 
480 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0299  putative sigma54 specific transcriptional regulator  54 
 
 
276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.54 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  47.28 
 
 
461 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  47.28 
 
 
461 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.28 
 
 
461 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5166  sigma-54 dependent transcriptional regulator  55.2 
 
 
276 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4419  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.58 
 
 
469 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.475055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  47.28 
 
 
461 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  47.28 
 
 
461 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3097  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.85 
 
 
427 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1534  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.54 
 
 
463 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31690  Sigma54 -dependent activator protein  55.08 
 
 
309 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2494  response regulator receiver protein  50.15 
 
 
452 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  47.62 
 
 
461 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.07 
 
 
458 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0327  sigma-54 factor, interaction region  52.4 
 
 
316 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.768789  normal  0.257375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.88 
 
 
458 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0874  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.73 
 
 
464 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4383  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.06 
 
 
483 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5073  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  54.8 
 
 
276 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0590  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.94 
 
 
440 aa  255  7e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.71 
 
 
478 aa  255  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1175  transcriptional regulator  51.06 
 
 
324 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.75 
 
 
448 aa  255  8e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4406  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.06 
 
 
483 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.81 
 
 
462 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.1 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4250  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.42 
 
 
483 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0737  putative sigma54 specific transcriptional regulator  45.71 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0198  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.47 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3932  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.06 
 
 
451 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215439  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.64 
 
 
483 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.5 
 
 
490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.41 
 
 
478 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.06 
 
 
451 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2827  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.75 
 
 
470 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.27 
 
 
1079 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.48 
 
 
489 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2438  helix-turn-helix, Fis-type  57.38 
 
 
451 aa  252  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.213238  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.48 
 
 
489 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.65 
 
 
458 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  54.85 
 
 
480 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2592  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.02 
 
 
441 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2180  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 
455 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1577  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.93 
 
 
458 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2970  sigma-54 factor, interaction region  53.56 
 
 
445 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.62 
 
 
480 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.19 
 
 
448 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0236  sigma-54 transcriptional regulatory protein  43.87 
 
 
342 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143809  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3471  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.9 
 
 
489 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0709  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.87 
 
 
342 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.821581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  56.6 
 
 
496 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.12 
 
 
688 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1772  putative sigma54 specific transcriptional regulator  45.13 
 
 
386 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.3 
 
 
476 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0775  helix-turn-helix, Fis-type  44.58 
 
 
457 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  43.79 
 
 
486 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.48 
 
 
466 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  43.41 
 
 
466 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.79 
 
 
515 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0682  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.64 
 
 
456 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105475  normal  0.791887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>