248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  100 
 
 		 420 aa  809    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  59.09 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  58.46 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  59.43 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  55.66 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  54.94 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  54.46 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  53.73 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  59.1 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  53.73 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  60.05 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  53.7 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  46.59 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  47.14 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  45.08 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  43.13 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.04 
 
 		 440 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  39.53 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  39.02 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  37.83 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  37.86 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  39.49 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  35.82 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  36.19 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  39.33 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  35.65 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  36.06 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  35.9 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  34.13 
 
 		 402 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  38.23 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  36.3 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  34.45 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  36.06 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  36.06 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.06 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  35.9 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  38 
 
 		 422 aa  249  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  37.89 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  36.06 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  35.65 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  36.05 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  37.05 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  35.58 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  34.29 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.15 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  37.28 
 
 		 419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  35.23 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  35.98 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  36.41 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  35.87 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.64 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  34.56 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.27 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  35.01 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  35.12 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  33.89 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  36.47 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  34.65 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.17 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  37.15 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  37.15 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  34.19 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  34.21 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 419 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  37.35 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  34.05 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  36.92 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  34.52 
 
 		 585 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.68 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  33.26 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  36.13 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  33.25 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  33.95 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  36.64 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  34.25 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  33.26 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  36.68 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  35.66 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  33.26 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  34.81 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  34.81 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  35.88 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  34.55 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  34.05 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  32.51 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  34.05 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  34.59 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  35.11 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.87 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  30.52 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  33.57 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  33.81 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  35.75 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  32.15 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  35.32 
 
 		 401 aa  216  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>