More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7397 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  100 
 
 		 382 aa  783    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  38.16 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  39.32 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  41.44 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  38.44 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  38.77 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  32.38 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  28.53 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  29.66 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.61 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.08 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.84 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  25.44 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.09 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.46 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.62 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  25 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.75 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  26.74 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.67 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.62 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  27.37 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  24.81 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  23.31 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.56 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  25 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.82 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.52 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.04 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  21.47 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  27.6 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26.13 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  21.89 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.21 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.02 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.02 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.07 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.57 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  23.31 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  26.25 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  23.73 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  28.22 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  28.22 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  28.22 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  27.25 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.46 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.48 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  28.22 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  28.22 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  27.71 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.69 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.9 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  25.38 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  28.22 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  28.22 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  28.22 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  28.22 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  25.08 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  23.08 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  31.32 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  25.91 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  25.51 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  26.03 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  21.71 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  28.3 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  23.95 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  25.93 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.94 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  27.66 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.45 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.41 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  23.08 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  27.31 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.63 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.23 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  26.02 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  24.56 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  22.25 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  23.79 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  27.09 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  27.24 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  27.67 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.35 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  25.51 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  23.74 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  22.81 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.05 
 
 		 608 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  29.52 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  29.18 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>