206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5583 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  100 
 
 		 342 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  62.05 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  55.79 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  56.29 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  56.38 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  54.65 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  51.52 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  50.91 
 
 		 336 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  45.85 
 
 		 357 aa  298  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  43.43 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  44.48 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  45.65 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  44.85 
 
 		 335 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  44.75 
 
 		 362 aa  285  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  44.24 
 
 		 335 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  44.68 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  42.51 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.54 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  31.1 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  22.33 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.15 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  25.64 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  25.55 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  26.58 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  23.89 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  22.82 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  21.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  25 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.58 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  22.22 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.08 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  22.95 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.24 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  24.26 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.4 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  25.86 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.49 
 
 		 438 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  21.67 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  21.92 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  27.02 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  24.62 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  22.9 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  20.1 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  28.67 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  25.15 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  22.43 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 715 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.34 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  24.12 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  24.58 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.11 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  29.71 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>