More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5007 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  100 
 
 
563 aa  1147    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  50.76 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  50.58 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  48.74 
 
 
536 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  48.56 
 
 
549 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.36 
 
 
540 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.8 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  46.08 
 
 
545 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.45 
 
 
540 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.21 
 
 
532 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.97 
 
 
532 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  43.97 
 
 
532 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.97 
 
 
532 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  44.68 
 
 
532 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.51 
 
 
526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.89 
 
 
646 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.61 
 
 
556 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.81 
 
 
576 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.01 
 
 
608 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.63 
 
 
589 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  23.55 
 
 
574 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  27.84 
 
 
954 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  27.07 
 
 
646 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  25.93 
 
 
573 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.27 
 
 
566 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  25.49 
 
 
578 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.37 
 
 
638 aa  87  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  24.33 
 
 
574 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  24.33 
 
 
574 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  25.14 
 
 
576 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  23.84 
 
 
574 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  22.74 
 
 
576 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.17 
 
 
648 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26.76 
 
 
578 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  24.94 
 
 
591 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.08 
 
 
648 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.08 
 
 
648 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.87 
 
 
644 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  26.48 
 
 
609 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.25 
 
 
579 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.82 
 
 
610 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  24.18 
 
 
575 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.68 
 
 
540 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  26.79 
 
 
580 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  23.72 
 
 
584 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  26.6 
 
 
582 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  23.27 
 
 
582 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.86 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  27.01 
 
 
582 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.51 
 
 
587 aa  77.8  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 
644 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  23.44 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.96 
 
 
643 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  26.68 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  23.91 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.4 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.62 
 
 
552 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  24.24 
 
 
641 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  23.8 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  23.42 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.4 
 
 
621 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  23.29 
 
 
580 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  26.8 
 
 
548 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.25 
 
 
623 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  26.8 
 
 
548 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.61 
 
 
566 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.53 
 
 
570 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  24.74 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  25.32 
 
 
569 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.6 
 
 
594 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.04 
 
 
637 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  26.62 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.73 
 
 
566 aa  68.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  28.31 
 
 
532 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  22.57 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  23.57 
 
 
556 aa  67  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1283  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.33 
 
 
612 aa  67  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.714397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  23.12 
 
 
565 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.56 
 
 
627 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  24.45 
 
 
863 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.21 
 
 
637 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  22.12 
 
 
579 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  23.13 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.04 
 
 
512 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.77 
 
 
646 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.91 
 
 
600 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  22.95 
 
 
579 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.89 
 
 
591 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  23.2 
 
 
590 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.53 
 
 
584 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  27.6 
 
 
538 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.2 
 
 
590 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.2 
 
 
590 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.2 
 
 
590 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.2 
 
 
590 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.43 
 
 
568 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  24.86 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.79 
 
 
568 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.79 
 
 
681 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>