222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0881 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  339  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  42.33 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  42.14 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  37.42 
 
 		 176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  35.76 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.802563 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  32.5 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  29.88 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  37.42 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  32.14 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  31.1 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  32.18 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  32.73 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  30.25 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  32.12 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  31.06 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  32.1 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  30.06 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  30.86 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  30.95 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  30.25 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.19 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  30.72 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  30.06 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  30.91 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  29.45 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  27.5 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  28.75 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  28.79 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  28.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  30.3 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  27.54 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  27.5 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  26.59 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  28.74 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  30.59 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  27.5 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  29.41 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  31.06 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  26.06 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  27.54 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  30.77 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  32.7 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  29.31 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  28.92 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  30.06 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.54 
 
 		 937 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  27.22 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.54 
 
 		 937 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  29.37 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  27.5 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  27.85 
 
 		 220 aa  60.5  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  26.67 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  31.61 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  32.79 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  26.99 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  26.53 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  28.95 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  28.99 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.81 
 
 		 892 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  29.48 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  28.99 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  27.04 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  27.04 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.92 
 
 		 867 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  25.44 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  35.54 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  25.75 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  31.06 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  32.48 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.6 
 
 		 1107 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28.8 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  26.38 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  27.81 
 
 		 314 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  26.09 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  27.33 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  28.34 
 
 		 199 aa  50.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  27.45 
 
 		 237 aa  50.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  26.32 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  25.16 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  28.42 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  29.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  33.67 
 
 		 596 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  33.67 
 
 		 596 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1243  GTP-binding protein LepA  27.94 
 
 		 596 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000510522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1199  GTP-binding protein LepA  27.94 
 
 		 596 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  33.67 
 
 		 596 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  27.94 
 
 		 596 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3114  GTP-binding protein LepA  27.94 
 
 		 596 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000355263  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  27.78 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1276  GTP-binding protein LepA  27.94 
 
 		 596 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000630436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  25.61 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  36.96 
 
 		 596 aa  48.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2587  GTP-binding protein LepA  36.96 
 
 		 605 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1157  GTP-binding protein LepA  31.58 
 
 		 596 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  25.3 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  26.51 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  26.51 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>