72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0578 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
492 aa  974    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.4 
 
 
642 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  27.94 
 
 
643 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
670 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.26 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.23 
 
 
641 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  33.33 
 
 
958 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.58 
 
 
666 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.94 
 
 
646 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 
1343 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.23 
 
 
667 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  26.17 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
1181 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  33.03 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.32 
 
 
1094 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.4 
 
 
644 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.4 
 
 
546 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.58 
 
 
510 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.2 
 
 
490 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.21 
 
 
1148 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 
1438 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  34 
 
 
421 aa  60.1  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.64 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  22.32 
 
 
593 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
221 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 
668 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.4 
 
 
214 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.66 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.75 
 
 
1216 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.41 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.9 
 
 
959 aa  53.5  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  33.87 
 
 
886 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.37 
 
 
323 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.5 
 
 
835 aa  51.2  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.35 
 
 
395 aa  50.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.52 
 
 
206 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0319  response regulator receiver protein  23.13 
 
 
538 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  25.54 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.57 
 
 
557 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  24.31 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.6 
 
 
215 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.89 
 
 
197 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  26.03 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.01 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1117  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 
226 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.9 
 
 
178 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.94 
 
 
445 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.66 
 
 
192 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  24.29 
 
 
1224 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.35 
 
 
303 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
1412 aa  47  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.61 
 
 
1133 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.2 
 
 
121 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.92 
 
 
377 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  36.47 
 
 
822 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.87 
 
 
831 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.89 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.43 
 
 
150 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33 
 
 
157 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.17 
 
 
180 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.19 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.23 
 
 
251 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.21 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.18 
 
 
168 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.57 
 
 
220 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  29.32 
 
 
213 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.02 
 
 
464 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.24 
 
 
1139 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1322  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.96 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.488747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  22.34 
 
 
218 aa  43.9  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.76 
 
 
408 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>