More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0319 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0319  response regulator receiver protein  100 
 
 		 538 aa  1092    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 123 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  38.83 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 130 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  33.59 
 
 		 1983 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  40.68 
 
 		 131 aa  77.4  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.75 
 
 		 229 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 122 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 127 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 123 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 139 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 707 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  35.83 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 126 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 124 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 126 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 2026 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 765 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  42.34 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  42.34 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  34.78 
 
 		 2026 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  35 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  35 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  38.98 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  35 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  38.98 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  35 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 2301 aa  73.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  36.27 
 
 		 322 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 228 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  38.98 
 
 		 124 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  40.54 
 
 		 128 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 132 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 127 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 244 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 126 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 121 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 126 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 235 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 224 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 266 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 235 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  35 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  36.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.5 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  34.45 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4215  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 133 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  35.78 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>