294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3880 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  83.25 
 
 		 392 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 386 aa  790    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  71.2 
 
 		 387 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.58 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  64.74 
 
 		 403 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  64.63 
 
 		 410 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  66.31 
 
 		 390 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.31 
 
 		 390 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.83 
 
 		 390 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.77 
 
 		 390 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  59.57 
 
 		 380 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.38 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  24.86 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  24.27 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  27.19 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  25.97 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  26.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  23.82 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  27.24 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  23.04 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  23.6 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  27.33 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  25.45 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  25.96 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  27.58 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  28.06 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  26.42 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  27.42 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  24.76 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  27.42 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  26.45 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  27.69 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  27.09 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  26.4 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  25.27 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  25.27 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  25.38 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  24.8 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  26.5 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  25.18 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  23.1 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  25.29 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  23.41 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  26.06 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  25.73 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  25.73 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  23.92 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  25.71 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  25.82 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  26.86 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  25.91 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  25.73 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  26.61 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  23.77 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  26.13 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  26.95 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  25.4 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  27.99 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  22.82 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  26.16 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  23.28 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  26.77 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  23.96 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  25.68 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  24.08 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  24.25 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  26.4 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  26.58 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  27.69 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  25.71 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  22.7 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  26.21 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  24.38 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  24.58 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  24.69 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  24.18 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  22.7 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  25.97 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  22.87 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  23.49 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  21.18 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  21.95 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  23.1 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  24.84 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  26.52 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  24.76 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  24.66 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  24.2 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  24.22 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  21.83 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  21.83 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>