More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0627 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  100 
 
 
411 aa  844    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  78.52 
 
 
406 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  82.02 
 
 
403 aa  675    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  78.02 
 
 
406 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  84.24 
 
 
406 aa  688    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  84.98 
 
 
406 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  80.9 
 
 
377 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  48.06 
 
 
406 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.1 
 
 
408 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  43.44 
 
 
405 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.87 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  42.23 
 
 
399 aa  308  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  43.55 
 
 
408 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  42.13 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  40.91 
 
 
399 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  42.32 
 
 
374 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  41.94 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  41.27 
 
 
370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  41.06 
 
 
371 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  42.78 
 
 
377 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  42.94 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  40.11 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  41.1 
 
 
374 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 
377 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  39.51 
 
 
366 aa  272  7e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  38.72 
 
 
372 aa  269  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  40.05 
 
 
377 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  40.37 
 
 
379 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  39.3 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  38.08 
 
 
390 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  41.13 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  40.59 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  40.05 
 
 
372 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  43.6 
 
 
374 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  40.86 
 
 
377 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  39.57 
 
 
372 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  39.57 
 
 
372 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  37.77 
 
 
372 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  39.73 
 
 
371 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  40.32 
 
 
377 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  42.71 
 
 
377 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  40.96 
 
 
363 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  39.73 
 
 
371 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  39.73 
 
 
371 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  39.73 
 
 
371 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  38.1 
 
 
371 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  38.34 
 
 
376 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  41.42 
 
 
376 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  40.22 
 
 
371 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  41.89 
 
 
374 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.03 
 
 
363 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  39.69 
 
 
370 aa  256  6e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  39.46 
 
 
373 aa  255  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  38.89 
 
 
371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  38.2 
 
 
370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  38.92 
 
 
370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  39.5 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  39.19 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  38.89 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  39.5 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  41.11 
 
 
370 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  38.92 
 
 
370 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  38.76 
 
 
376 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  38.73 
 
 
371 aa  253  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  38.89 
 
 
371 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  40.91 
 
 
370 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  39.79 
 
 
371 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  38.36 
 
 
371 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  38.87 
 
 
370 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  37.07 
 
 
371 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  37.47 
 
 
371 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  37.6 
 
 
371 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  44.07 
 
 
376 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  38.95 
 
 
372 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  37.91 
 
 
365 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  41.62 
 
 
371 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  43.03 
 
 
362 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  38.36 
 
 
373 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  40.32 
 
 
371 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  41.02 
 
 
371 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  38.92 
 
 
377 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  36.46 
 
 
371 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  37.93 
 
 
371 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>