More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2866 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 374 aa  752    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  74.46 
 
 		 373 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  74.46 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  73.66 
 
 		 373 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  73.39 
 
 		 373 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  69.35 
 
 		 374 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  66.12 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  64.78 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  63.98 
 
 		 377 aa  508  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  64.25 
 
 		 377 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  64.52 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  67.58 
 
 		 373 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  64.25 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  64.61 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  64.34 
 
 		 377 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 377 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 377 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  63.14 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  61.92 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  58.97 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  61.25 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  57.41 
 
 		 374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  66.21 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  60.92 
 
 		 371 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  60.71 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  65.37 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  57.07 
 
 		 371 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  59.07 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  58.76 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  56.84 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  59.29 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  56.59 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  57.82 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  58.74 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  58.36 
 
 		 371 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  58.36 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  58.63 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  58.08 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  58.36 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  58.36 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  58.36 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  62.57 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  58.74 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  57.45 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  58.47 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  57.42 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  58.47 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  53.1 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  58.47 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  58.24 
 
 		 374 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  57.06 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  56.56 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  59.17 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  53.7 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  53.7 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  58.29 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  55.34 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  58.56 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  55.34 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 374 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  59.89 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  55.34 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  53.7 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  55.22 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  55.25 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  58.52 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  53.95 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  57.69 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  55.04 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  60.38 
 
 		 367 aa  394  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  57.81 
 
 		 378 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  57.8 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  58.33 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  57.8 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  57.8 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>