More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2026 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  87.57 
 
 		 370 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  89.76 
 
 		 371 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  89.76 
 
 		 371 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  91.89 
 
 		 371 aa  678    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  751    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  89.76 
 
 		 371 aa  686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  92.45 
 
 		 371 aa  683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  87.03 
 
 		 371 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  89.49 
 
 		 371 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  88.41 
 
 		 371 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  92.97 
 
 		 371 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  89.49 
 
 		 371 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  89.49 
 
 		 371 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  88.14 
 
 		 378 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  89.49 
 
 		 371 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  80.32 
 
 		 371 aa  615  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  79.25 
 
 		 374 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  78.98 
 
 		 374 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  78.92 
 
 		 372 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  77.09 
 
 		 374 aa  554  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  68.46 
 
 		 372 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  69.81 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  66.13 
 
 		 376 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  66.85 
 
 		 372 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  67.39 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  68.65 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  66.04 
 
 		 371 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 239 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000246944  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  65.23 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  64.19 
 
 		 372 aa  471  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  65.14 
 
 		 372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  66.22 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  68.6 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  67.3 
 
 		 372 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  63.34 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  64.15 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  63.88 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  66.76 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 		 369 aa  451  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  62.43 
 
 		 369 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 371 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  63.34 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 372 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  65.41 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  70.85 
 
 		 323 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  61.73 
 
 		 371 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  61.73 
 
 		 371 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  62.26 
 
 		 371 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  60.38 
 
 		 371 aa  431  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  62.26 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1682  L-alanine dehydrogenase  66.85 
 
 		 371 aa  428  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  62.91 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  60.16 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  54.74 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  61.81 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  62.43 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  60.44 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  62.16 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  58.68 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0458  L-alanine dehydrogenase  61.96 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  61.73 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  56.6 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  57.49 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  58.73 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  58.2 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1610  alanine dehydrogenase  64.59 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  57.85 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  53.24 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  57.53 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1433  alanine dehydrogenase  65.14 
 
 		 372 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  60.11 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  52.83 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>