More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2908 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 		 374 aa  738    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  75.34 
 
 		 379 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  77.78 
 
 		 376 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  78.86 
 
 		 376 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  58.54 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  58.79 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  55.4 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  57.88 
 
 		 371 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 373 aa  401  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  58.76 
 
 		 373 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  54.62 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  55.01 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  55.71 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  53.01 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  60.98 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  52.2 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.47 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 390 aa  391  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  54.08 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  54.47 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  55.98 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  54.08 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  55.98 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  54.74 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  61.08 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  56.04 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  54.93 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  54.93 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  56.52 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  60.05 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  56.52 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  57.34 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  55.98 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  52.22 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  53.26 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  56.52 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  56.39 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  52.82 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  56.37 
 
 		 373 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  54.52 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.01 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  55.98 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  55.16 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  52.03 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  55.83 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  53.97 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  55.37 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  55.34 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  55.06 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  50.83 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  54.35 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  55 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  53.8 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  53.39 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  51.49 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  51.49 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  55.98 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  51.76 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>