More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3380 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  755    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  89.92 
 
 
377 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  75.6 
 
 
377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  73.46 
 
 
377 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  72.65 
 
 
377 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  73.05 
 
 
377 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  73.58 
 
 
372 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  73.05 
 
 
377 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  71.85 
 
 
377 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 
377 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  73.63 
 
 
373 aa  544  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 
377 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  72.24 
 
 
377 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  72.24 
 
 
377 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  65.23 
 
 
372 aa  494  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  65.23 
 
 
372 aa  494  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  63.34 
 
 
371 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  68.36 
 
 
373 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  67.02 
 
 
373 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  67.56 
 
 
373 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  66.76 
 
 
373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  63.9 
 
 
374 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  63.34 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 
374 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  61.52 
 
 
371 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  66.04 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  60 
 
 
372 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  60.06 
 
 
376 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  57.41 
 
 
374 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  56.68 
 
 
390 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  57.45 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  59.57 
 
 
373 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  64.01 
 
 
341 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  57.18 
 
 
371 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  58.67 
 
 
376 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  62.88 
 
 
372 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  63.03 
 
 
372 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  59.3 
 
 
373 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  62.36 
 
 
372 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
372 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  61.29 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  58.79 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  59.41 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 
371 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  55.76 
 
 
373 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 
371 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  57.1 
 
 
371 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 
371 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  58.68 
 
 
372 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  58.9 
 
 
370 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  56.57 
 
 
370 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
370 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  53.1 
 
 
373 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  56.28 
 
 
371 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  58.9 
 
 
370 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  56.28 
 
 
371 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  56.28 
 
 
371 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 
371 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
371 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  58.63 
 
 
370 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
371 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  59.12 
 
 
372 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 
371 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  58.95 
 
 
371 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  56.56 
 
 
371 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  61.37 
 
 
367 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 
370 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 
371 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  59.3 
 
 
368 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
371 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  53.48 
 
 
373 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  54.79 
 
 
379 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  60.38 
 
 
372 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  57.78 
 
 
371 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  54.1 
 
 
380 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 
371 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 
371 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 
371 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  56.59 
 
 
371 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  56.59 
 
 
371 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 
372 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  56.59 
 
 
371 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  56.59 
 
 
371 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  53.57 
 
 
371 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>