More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2747 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  726    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  88.28 
 
 		 368 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  71.39 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  63.51 
 
 		 373 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  62.36 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  62.4 
 
 		 374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  60.71 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  61.08 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 377 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 377 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  60.33 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 		 377 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  60.33 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  60.71 
 
 		 371 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  58.36 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  57.89 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  58.82 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  58.82 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  62.7 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 		 370 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  58.79 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  59.46 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  60.98 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  58.38 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  61.37 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  58.4 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  59.19 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  57.84 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  58.9 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  60.7 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  56.22 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  57.85 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  59.89 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 371 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 371 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  58.92 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  59.19 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  58.68 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  58.38 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  61.54 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  58.11 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  58.11 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  54.89 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  57.49 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  57.84 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  58.11 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  60.38 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  58.01 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  58.54 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  59.89 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  58.92 
 
 		 376 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  61.81 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 371 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  61.54 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  60.61 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  58.92 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  58.65 
 
 		 373 aa  391  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  59.18 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  58.92 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  61.08 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  61.63 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  60.99 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  58.26 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>