More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2902 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 376 aa  766    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  83.29 
 
 		 372 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  79.19 
 
 		 370 aa  605  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  60 
 
 		 371 aa  464  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  61.35 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  59.03 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  59.19 
 
 		 373 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  56.83 
 
 		 366 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  62.43 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  59.57 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  61.35 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 371 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  57.82 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  58.09 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  58.09 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  58.09 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  57.82 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  58.09 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  58.09 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  58.09 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  60.45 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  57.82 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  57.29 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  59.28 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  59.18 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  58.29 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  58.38 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  61.13 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  61.39 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  61.92 
 
 		 374 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  60.06 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1553  L-alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.354351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  63.51 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  56.23 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1134  alanine dehydrogenase  57.84 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  61.35 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  59.79 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  59.25 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  55.19 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  55.71 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  51.35 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  51.35 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  60.42 
 
 		 341 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  57.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  53.93 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  52.3 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  49.46 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  51.35 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  49.73 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  52.75 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  54.05 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  49.73 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  51.35 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  53.78 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  55.34 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  55.99 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  54.05 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  52.7 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>