More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3512 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 377 aa  751    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  89.92 
 
 		 377 aa  670    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  76.19 
 
 		 372 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  74.54 
 
 		 377 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 		 377 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  72.39 
 
 		 377 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  72.51 
 
 		 377 aa  544  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  71.85 
 
 		 377 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  72.12 
 
 		 377 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  72.78 
 
 		 373 aa  544  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  72.24 
 
 		 377 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  70.9 
 
 		 377 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  71.7 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  71.43 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 377 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  64.69 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  67.02 
 
 		 373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  63.81 
 
 		 374 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  66.49 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  65.95 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 374 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  65.95 
 
 		 373 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  63.07 
 
 		 371 aa  454  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  67.76 
 
 		 370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  61.25 
 
 		 371 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  59.78 
 
 		 372 aa  435  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 374 aa  425  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  57.92 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  58.38 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  59.07 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  57.45 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  57.89 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  60.38 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  58.71 
 
 		 370 aa  411  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  58.93 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  63.44 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  63.16 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  63.31 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  61.02 
 
 		 370 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  60.11 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  59.13 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  59.3 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  63.03 
 
 		 372 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  63.42 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  59.67 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  58.87 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  58.87 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  58.87 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  58.04 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  59.94 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  58.04 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  58.04 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  56.32 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  55.11 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  61.19 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  57.5 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  56.67 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  57.5 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  56.06 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  57.5 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  55.4 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  60.55 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  55.12 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  57.42 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  57.42 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  54.79 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  55.22 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  56.63 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  57.42 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>