More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1176 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  753    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  95.41 
 
 		 371 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  71.62 
 
 		 370 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  71.08 
 
 		 370 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  71.08 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1553  L-alanine dehydrogenase  72.97 
 
 		 370 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.354351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  70 
 
 		 370 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1134  alanine dehydrogenase  66.22 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 		 370 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  59.62 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  64.05 
 
 		 369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  61.1 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  57.69 
 
 		 366 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  58.38 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  53.51 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  56.06 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  53.83 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  52.02 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  52.72 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  54.12 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  53.1 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  52.83 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  53.57 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  53.57 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  53.57 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  52.02 
 
 		 374 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  55.28 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  55.95 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  53.1 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  51.21 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  55.68 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  51.91 
 
 		 390 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  51.89 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  55.04 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  52.7 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  56.23 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  51.89 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  52.76 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  51.08 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  55.12 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  52.76 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  53.24 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  51.8 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>