More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1765 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  753    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  753    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  84.91 
 
 
371 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  69 
 
 
377 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
373 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  69 
 
 
377 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  66.85 
 
 
372 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 
377 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  65.23 
 
 
377 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  61.73 
 
 
371 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  63.61 
 
 
377 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  61.02 
 
 
374 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  58.81 
 
 
371 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  62.1 
 
 
373 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 
373 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 
373 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  61.46 
 
 
374 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  61.99 
 
 
373 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  60.65 
 
 
370 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  57.72 
 
 
370 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
376 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  56.59 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  55.86 
 
 
371 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  54.95 
 
 
371 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 
373 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  54.95 
 
 
371 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  54.95 
 
 
371 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
390 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  54.67 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  53.1 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  61.76 
 
 
341 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  61.19 
 
 
368 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  57.5 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
372 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  60.33 
 
 
367 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 
370 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 
371 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  59.14 
 
 
368 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  53.99 
 
 
371 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  53.5 
 
 
371 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.7 
 
 
373 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
363 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  53.37 
 
 
371 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 
371 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 
371 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
363 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 
371 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  53.01 
 
 
369 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 
371 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  55.76 
 
 
372 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  55.38 
 
 
371 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 
369 aa  381  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 
371 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  56.56 
 
 
371 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  54.67 
 
 
370 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  56.28 
 
 
371 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
370 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  57.42 
 
 
376 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 
372 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
370 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
371 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  56.28 
 
 
371 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  56.2 
 
 
369 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 
376 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  56.59 
 
 
371 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
370 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
372 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  55.74 
 
 
371 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  53.37 
 
 
374 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  55.46 
 
 
371 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  55.46 
 
 
371 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  55.74 
 
 
371 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5339  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 
369 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 
370 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 
371 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 
371 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 
370 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  53.72 
 
 
371 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
371 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>