More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0822 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  748    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  78.11 
 
 		 371 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  73.51 
 
 		 371 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  67.84 
 
 		 373 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  68.46 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  68.46 
 
 		 371 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  68.46 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  68.46 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 371 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  72.05 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  65.68 
 
 		 371 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  68.38 
 
 		 371 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  69.95 
 
 		 376 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  66.85 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  68.92 
 
 		 371 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  65.95 
 
 		 371 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 369 aa  474  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  64.82 
 
 		 372 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  65.43 
 
 		 380 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  63.07 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  64.54 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  64.27 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  65.59 
 
 		 380 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  66.21 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  58.71 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 377 aa  428  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  59.34 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03060  L-alanine dehydrogenase  66.2 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  62.71 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  57.8 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  61.5 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  57.69 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 377 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  56.06 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  59.44 
 
 		 372 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  58.73 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  56.28 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  59.83 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  61.22 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  59.03 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  59.03 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  59.03 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  63.41 
 
 		 374 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  55.65 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  58.1 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  56.6 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  56.6 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  53.51 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 373 aa  394  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  57.53 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  55.71 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  58.76 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  55.22 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  56.04 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>