More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3686 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 		 372 aa  738    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  69.73 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  69.73 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  69.19 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  69.73 
 
 		 371 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  68.92 
 
 		 371 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  68.92 
 
 		 371 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  68.92 
 
 		 371 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  67.47 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  68.92 
 
 		 370 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  67.96 
 
 		 371 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  68.41 
 
 		 371 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  70 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  68.65 
 
 		 378 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  68.33 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  68.38 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  68.38 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  65.59 
 
 		 372 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  67.3 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  67.3 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  66.04 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  67.49 
 
 		 372 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  67.13 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  67.13 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  69.35 
 
 		 372 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  66.12 
 
 		 372 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  67.03 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  67.22 
 
 		 374 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1682  L-alanine dehydrogenase  71.89 
 
 		 371 aa  461  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  68.65 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  69.19 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  64.25 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  67.49 
 
 		 374 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  66.02 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  67.13 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 374 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  65.56 
 
 		 371 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  65.05 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  66.76 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  65.41 
 
 		 374 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  63.24 
 
 		 369 aa  448  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  67.22 
 
 		 374 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  65.68 
 
 		 373 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  65.5 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  71.16 
 
 		 323 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  64.05 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  64.05 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 371 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 		 371 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  67.03 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  63.27 
 
 		 373 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  63.34 
 
 		 371 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  65.81 
 
 		 372 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  59.46 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  58.6 
 
 		 371 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  66.67 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  59.19 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  61.62 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  61.37 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  66.38 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  62.22 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  65.85 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  58.11 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  58.6 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0458  L-alanine dehydrogenase  65.19 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  65.28 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1610  alanine dehydrogenase  65.77 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  61.62 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1433  alanine dehydrogenase  65.77 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698493 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  60.11 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  55.14 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.6 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  55.43 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  58.2 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  59.84 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  55.76 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  57.38 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>