More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1334 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  100 
 
 
376 aa  746    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  59.56 
 
 
372 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 
372 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 
371 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  57.98 
 
 
372 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  57.02 
 
 
372 aa  401  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  58.92 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  59.5 
 
 
370 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  59.23 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  56.35 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  56.35 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  57.5 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  56.35 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  58.38 
 
 
373 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 
371 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  60.11 
 
 
372 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  56.04 
 
 
371 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  59.23 
 
 
370 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  58.56 
 
 
371 aa  391  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  54.59 
 
 
371 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  56.23 
 
 
371 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.91 
 
 
377 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  59.62 
 
 
371 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  56.2 
 
 
371 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  56.2 
 
 
371 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  56.2 
 
 
371 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  55.37 
 
 
371 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  55.37 
 
 
371 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  55.96 
 
 
371 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  59.19 
 
 
373 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.96 
 
 
371 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  55.96 
 
 
371 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  58.73 
 
 
374 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  58.11 
 
 
371 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  56.27 
 
 
372 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 
370 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  56.63 
 
 
371 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 
371 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 
376 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  55.95 
 
 
372 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 
374 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  54.35 
 
 
370 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  54.35 
 
 
366 aa  381  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  53.87 
 
 
372 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  59.72 
 
 
372 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 
373 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  56.44 
 
 
371 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  58.49 
 
 
371 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  52.29 
 
 
371 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  57.22 
 
 
374 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  53.78 
 
 
373 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 
371 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 
371 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 
371 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 
371 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  53.78 
 
 
370 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
372 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  56.32 
 
 
371 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  55.62 
 
 
371 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  51.63 
 
 
371 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 
371 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 
373 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  55.62 
 
 
371 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  53.24 
 
 
370 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  58.61 
 
 
370 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  55.22 
 
 
371 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 
372 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  54.67 
 
 
371 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 
371 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
374 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  53.3 
 
 
373 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  55.34 
 
 
371 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  53.78 
 
 
371 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  61.22 
 
 
372 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  54.7 
 
 
369 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  57.79 
 
 
361 aa  368  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  62.05 
 
 
372 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 
372 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  55.99 
 
 
369 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  56.23 
 
 
371 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  54.05 
 
 
371 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 
371 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
374 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 
372 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
371 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  57.34 
 
 
378 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 
368 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
371 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  55.71 
 
 
369 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
370 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
371 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  55.38 
 
 
377 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 
371 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  61.77 
 
 
372 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  54.05 
 
 
371 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
379 aa  364  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 
374 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  51.48 
 
 
377 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 
371 aa  363  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>