More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6248 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 368 aa  725    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  73.13 
 
 		 371 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  70.68 
 
 		 371 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  72.05 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  70.36 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  69.86 
 
 		 373 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  70.91 
 
 		 371 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  65.75 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  65.75 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  65.47 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  69.61 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  65.84 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  65.63 
 
 		 371 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  66.85 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  67.4 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  65.75 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  66.01 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  69.13 
 
 		 376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  67.61 
 
 		 371 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  64.19 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  65.37 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  63.84 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  63.26 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03060  L-alanine dehydrogenase  65.92 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  62.98 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  68.22 
 
 		 371 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  62.98 
 
 		 372 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  58.08 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  58.95 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  58.95 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  68.8 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  57.89 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  57.89 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  57.58 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  64.39 
 
 		 380 aa  420  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  57.89 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  58.68 
 
 		 371 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  57.62 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  56.32 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  60.77 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 		 377 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  55.59 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  56.04 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  58.15 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  56.74 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  55.96 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  58.31 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  58.45 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  59.22 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  57.06 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  55.22 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  61.37 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  56.79 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  55.77 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  60.11 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  57.54 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.98 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  62.33 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  55.37 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.55 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  56.98 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  60.11 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  57.06 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  52.47 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  54.52 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  53.3 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  53.3 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  63.75 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  51.93 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  61.43 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  54.5 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  57.26 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  58.13 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  56.98 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  58.59 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  50.83 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  58.15 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  59.78 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  58.58 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  56.11 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>