More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4430 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  750    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  82.7 
 
 		 371 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  81.35 
 
 		 371 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  77.03 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  73.78 
 
 		 371 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  69.19 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  70 
 
 		 371 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  68.92 
 
 		 371 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  68.38 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  73.51 
 
 		 371 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  70.91 
 
 		 368 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  70.4 
 
 		 371 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  65.41 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  67.59 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  67.59 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  67.59 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  63.78 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  68.38 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  65.24 
 
 		 376 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  64.93 
 
 		 369 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  65.95 
 
 		 371 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  64.59 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  62.88 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  63.71 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  63.99 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  65.67 
 
 		 370 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03060  L-alanine dehydrogenase  61.45 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  60.06 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 380 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  54.3 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  53.49 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.03 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  53.49 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  53.49 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  54.7 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  55.87 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  52.56 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  52.96 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  52.15 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  56.3 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  51.61 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  55.03 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  50.54 
 
 		 370 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  51.25 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  54.22 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  54.57 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  53.46 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.18 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  56.42 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  52.16 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  54.29 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.08 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  59.76 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  53.31 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  55.4 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  54.47 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 376 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  52.1 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  55.33 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  53.51 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  51.09 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  51.75 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  52.51 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  54.03 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  51.75 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  54.42 
 
 		 373 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  54.47 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  55.1 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  49.03 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>