More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1608 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  744    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  58.89 
 
 
371 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  58.5 
 
 
371 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  58.33 
 
 
371 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  58.77 
 
 
369 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  58.22 
 
 
371 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  58.77 
 
 
371 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  58.22 
 
 
371 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  59.61 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.25 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  54.12 
 
 
377 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 
377 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
377 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  54.12 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.7 
 
 
372 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  55.01 
 
 
373 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  53.57 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.52 
 
 
377 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 
370 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  57.18 
 
 
371 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 
373 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  57.75 
 
 
376 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  62.95 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  54.97 
 
 
373 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  59.05 
 
 
380 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03060  L-alanine dehydrogenase  59.12 
 
 
371 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  51.37 
 
 
372 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  51.37 
 
 
372 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  51.12 
 
 
372 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.22 
 
 
377 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  56.98 
 
 
371 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  56.42 
 
 
371 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  52.63 
 
 
367 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  57.18 
 
 
371 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  57.5 
 
 
372 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  59.38 
 
 
371 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  57.78 
 
 
373 aa  378  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  58.58 
 
 
368 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  49.32 
 
 
376 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
379 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  51.64 
 
 
371 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  58.12 
 
 
361 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
371 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  56.11 
 
 
371 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  57.82 
 
 
372 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  57.82 
 
 
372 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
372 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  49.73 
 
 
371 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  59.05 
 
 
368 aa  371  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  50.95 
 
 
374 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  52.21 
 
 
367 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  49.32 
 
 
371 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 
377 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 
390 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  52.65 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  56.6 
 
 
371 aa  362  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  54.12 
 
 
373 aa  361  9e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  57.02 
 
 
374 aa  360  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  54.44 
 
 
374 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  53.85 
 
 
373 aa  359  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  54.21 
 
 
376 aa  359  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 
372 aa  358  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  53.04 
 
 
371 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  50.68 
 
 
371 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  55.86 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5339  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  51.22 
 
 
372 aa  355  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  57.78 
 
 
371 aa  354  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  52.22 
 
 
372 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  51.65 
 
 
377 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  53.07 
 
 
374 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  53.02 
 
 
370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  53.02 
 
 
370 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  56.55 
 
 
367 aa  348  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  52.99 
 
 
374 aa  348  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 
369 aa  348  9e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  49.58 
 
 
366 aa  348  9e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  58.01 
 
 
370 aa  348  9e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 
369 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  51.92 
 
 
371 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 
368 aa  347  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  50.28 
 
 
376 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
373 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>