More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1557 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 372 aa  754    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  68.46 
 
 		 373 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  68.19 
 
 		 373 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  67.3 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  66.85 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  65.96 
 
 		 376 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  66.85 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  66.31 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  66.04 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  65.11 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  65.68 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  68.38 
 
 		 371 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  64.84 
 
 		 369 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  67.39 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  67.12 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  67.68 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  65.68 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  63.71 
 
 		 372 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  65.68 
 
 		 371 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  66.31 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  65.5 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  66.58 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  65.05 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  65.05 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  63.34 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  66.04 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  64.15 
 
 		 371 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  65.59 
 
 		 372 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  67.77 
 
 		 372 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  63.16 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  66.31 
 
 		 371 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  64.69 
 
 		 374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  65.23 
 
 		 374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  65.14 
 
 		 372 aa  441  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  60.22 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  64.15 
 
 		 371 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  62.26 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  63.81 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  63.34 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  64.32 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  64.32 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  64.32 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 372 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  64.59 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  60.48 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  58.47 
 
 		 374 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  68.63 
 
 		 323 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  58.18 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  66.3 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  58.76 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  57.64 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  57.64 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  64.19 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  57.91 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  57.95 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  62.22 
 
 		 370 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  59.3 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  61.62 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1610  alanine dehydrogenase  65.14 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  56.06 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  56.06 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  62.97 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1682  L-alanine dehydrogenase  63.61 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  63.99 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  58.49 
 
 		 371 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1433  alanine dehydrogenase  64.59 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0458  L-alanine dehydrogenase  63.81 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>