More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1847 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  99.46 
 
 
370 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  98.65 
 
 
370 aa  728    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  63.24 
 
 
372 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  57.84 
 
 
371 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  57.77 
 
 
374 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  58.02 
 
 
376 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 
372 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  60.27 
 
 
371 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  56.6 
 
 
373 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
371 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  58.38 
 
 
372 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  60.81 
 
 
371 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  58.11 
 
 
371 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  58.11 
 
 
371 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  58.11 
 
 
371 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 
371 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
371 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
371 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  60.27 
 
 
371 aa  421  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
371 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 
372 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 
371 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  56.06 
 
 
377 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  58.87 
 
 
377 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  63.61 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  59.73 
 
 
374 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  60.16 
 
 
373 aa  411  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
371 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 
370 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  62.97 
 
 
372 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.72 
 
 
377 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  55.41 
 
 
371 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  55.41 
 
 
371 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  55.41 
 
 
371 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  59.62 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  56.44 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  60.54 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 
371 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 
372 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 
371 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  59.73 
 
 
372 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
371 aa  401  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 
371 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  58.68 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 
374 aa  398  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  59.29 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  59.02 
 
 
374 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  58.68 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  54.59 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  59.46 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  57.3 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  58.68 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  62.87 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  53.74 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  54.2 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
369 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  53.51 
 
 
371 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  57.03 
 
 
372 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  62.7 
 
 
372 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
372 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  55.74 
 
 
373 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 
369 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  56.76 
 
 
378 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  58.4 
 
 
371 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  58.4 
 
 
371 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 
372 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  59.02 
 
 
374 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  55.77 
 
 
390 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
370 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  62.7 
 
 
372 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 
371 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  57.81 
 
 
373 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  58.4 
 
 
371 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 
374 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  54.92 
 
 
371 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>