More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1449 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  96.77 
 
 		 371 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  84.05 
 
 		 371 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  83.51 
 
 		 371 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  83.78 
 
 		 371 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  82.7 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  82.7 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  82.43 
 
 		 371 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  82.7 
 
 		 371 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  75.41 
 
 		 371 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  70.35 
 
 		 374 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  63.78 
 
 		 372 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  70.54 
 
 		 371 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  64.32 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  63.51 
 
 		 372 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  64.07 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 371 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  62.43 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  61.98 
 
 		 371 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  61.62 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  61.11 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  61.08 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  61.54 
 
 		 371 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  61.71 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  61.71 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  61.71 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  63.16 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  64.32 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  63.34 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  61.08 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  62.84 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  62.4 
 
 		 369 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  62.12 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  61.08 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  60.81 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  62.57 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  65.21 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  65.21 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  60.54 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  61.35 
 
 		 372 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  63.74 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  60.71 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  60.71 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  63.07 
 
 		 371 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  60.44 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  60.55 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  61.62 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  62.05 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  58.22 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  58.92 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  60.92 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  59.89 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  55.11 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 370 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  58.92 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  53.99 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  58.76 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  61.89 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  54.72 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  54.3 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 376 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  54.3 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  54.57 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  59.19 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  54.57 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  60.11 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  62.4 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  54.57 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  54.05 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  54.84 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1682  L-alanine dehydrogenase  62.43 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  57.8 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 373 aa  391  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  59.62 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  61.46 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  59.73 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>