More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1609 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4283  alanine dehydrogenase  78.67 
 
 
362 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  72.5 
 
 
362 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0176  L-alanine dehydrogenase  74.52 
 
 
362 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000378959  normal  0.0330908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  70.28 
 
 
361 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  70.28 
 
 
363 aa  498  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3584  alanine dehydrogenase  71.75 
 
 
363 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  56.02 
 
 
373 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.06 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  54.62 
 
 
373 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
372 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
372 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
390 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
377 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
371 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  58.82 
 
 
367 aa  378  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 
368 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
371 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  51.54 
 
 
377 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  55.27 
 
 
371 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.09 
 
 
371 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
371 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  55.27 
 
 
371 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  50.97 
 
 
376 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
371 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
371 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  51.54 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  55.27 
 
 
371 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
371 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
371 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
373 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  52.51 
 
 
374 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  53.59 
 
 
372 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.27 
 
 
371 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
371 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  371  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  51.26 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
372 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  50.68 
 
 
371 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  59.1 
 
 
368 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  54.9 
 
 
370 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  51.53 
 
 
374 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  56.14 
 
 
374 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 
366 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  51.96 
 
 
372 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  52.38 
 
 
371 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
371 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  49.57 
 
 
371 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  49.3 
 
 
370 aa  359  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  52.37 
 
 
372 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
376 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  54.6 
 
 
371 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
370 aa  358  9e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  54.08 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  54.87 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.87 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  51.78 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  49.57 
 
 
371 aa  355  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  55.43 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  52.29 
 
 
360 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  52.6 
 
 
377 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  51.25 
 
 
371 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  53.09 
 
 
369 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  54.87 
 
 
371 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  52.96 
 
 
376 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  51.46 
 
 
379 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
371 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  51.13 
 
 
367 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  55.87 
 
 
373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  52.37 
 
 
373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
373 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  54.44 
 
 
374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 
373 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  48.84 
 
 
371 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  55.15 
 
 
371 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  48.84 
 
 
371 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  55.23 
 
 
368 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  53.17 
 
 
373 aa  348  6e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>