More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3174 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 
361 aa  732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  70.28 
 
 
363 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  70.28 
 
 
363 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  71.11 
 
 
362 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0176  L-alanine dehydrogenase  74.03 
 
 
362 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000378959  normal  0.0330908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3584  alanine dehydrogenase  72.85 
 
 
363 aa  498  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4283  alanine dehydrogenase  72.78 
 
 
362 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  68.33 
 
 
363 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  56.46 
 
 
377 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.18 
 
 
372 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.82 
 
 
371 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  51.82 
 
 
373 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  54.06 
 
 
373 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  55.43 
 
 
372 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  55.43 
 
 
372 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 
371 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  51.53 
 
 
376 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  54.91 
 
 
374 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  51.81 
 
 
390 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 
371 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 
371 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  54.55 
 
 
371 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  54.55 
 
 
371 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  54.55 
 
 
371 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 
371 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  53.62 
 
 
371 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  50.98 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  54.62 
 
 
371 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
371 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
372 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 
371 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  52.33 
 
 
377 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.7 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
377 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 
377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  50.99 
 
 
366 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  53.48 
 
 
371 aa  363  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  56.74 
 
 
373 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  52.78 
 
 
372 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  53.31 
 
 
370 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
370 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  56.18 
 
 
373 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  55.74 
 
 
368 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  56.46 
 
 
373 aa  359  4e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  54.49 
 
 
377 aa  358  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  54.2 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  56.74 
 
 
373 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  50.42 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  49.44 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  51.56 
 
 
372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  49.04 
 
 
371 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  49.04 
 
 
371 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  49.04 
 
 
371 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  51.87 
 
 
371 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  51.25 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  49.86 
 
 
371 aa  352  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  51.73 
 
 
370 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  52.74 
 
 
372 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  51.74 
 
 
371 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
366 aa  350  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  47.91 
 
 
374 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  48.48 
 
 
371 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  51.53 
 
 
372 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  52.72 
 
 
374 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 
371 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  49.44 
 
 
367 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  53.12 
 
 
371 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
378 aa  344  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5339  alanine dehydrogenase  53.2 
 
 
369 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  55.07 
 
 
371 aa  343  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  50.29 
 
 
372 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  55.05 
 
 
341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  53.33 
 
 
371 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  46.8 
 
 
371 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  50.28 
 
 
371 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  56.07 
 
 
374 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 
370 aa  341  9e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  54.2 
 
 
371 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  49.01 
 
 
360 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  54.49 
 
 
371 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  52.39 
 
 
374 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>