More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1760 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  723    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  70.28 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  70.28 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  72.22 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  68.33 
 
 		 361 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4283  alanine dehydrogenase  70.28 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0176  L-alanine dehydrogenase  68.98 
 
 		 362 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000378959  normal  0.0330908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3584  alanine dehydrogenase  68.7 
 
 		 363 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  56.15 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  60.22 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  54.06 
 
 		 373 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.74 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.47 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  52.51 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  54.04 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  54.04 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  53.2 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  52.51 
 
 		 377 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 377 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  54.04 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  54.47 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  51.96 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  53.35 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  51.81 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  52.22 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  58.26 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  50.28 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  49.72 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  58.54 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  51.24 
 
 		 371 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.87 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 378 aa  362  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  51.24 
 
 		 371 aa  361  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  49.31 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  52.65 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  51.67 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  52.23 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  53.2 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  50.84 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  54.78 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  54.78 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  52.37 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  54.04 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  53.48 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  54.87 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  53.56 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  52.09 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 373 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  50.28 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 374 aa  355  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  52.94 
 
 		 377 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 		 371 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  54.7 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  52.82 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  52.09 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  47.63 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  52.37 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  54.62 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  52.65 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  53.48 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  51.96 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  53.42 
 
 		 373 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 		 370 aa  352  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  51.81 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>