More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0176 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0176  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 
362 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000378959  normal  0.0330908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3584  alanine dehydrogenase  85.87 
 
 
363 aa  586  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  74.52 
 
 
363 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  74.52 
 
 
363 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  74.03 
 
 
361 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  73.2 
 
 
362 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4283  alanine dehydrogenase  77.29 
 
 
362 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  68.98 
 
 
363 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  53.06 
 
 
376 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.78 
 
 
372 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  53.35 
 
 
373 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  54.19 
 
 
373 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  53.89 
 
 
372 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  53.89 
 
 
372 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  54.9 
 
 
377 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
377 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
377 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  51.67 
 
 
372 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  56.53 
 
 
371 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  51.54 
 
 
371 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 
377 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  50.83 
 
 
370 aa  378  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  55.83 
 
 
371 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  55.83 
 
 
371 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  53.07 
 
 
377 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  54.04 
 
 
374 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  55.83 
 
 
371 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  56.25 
 
 
371 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 
377 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.04 
 
 
377 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  53.76 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  55.97 
 
 
371 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.97 
 
 
371 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  55.97 
 
 
371 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  55.03 
 
 
370 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  53.48 
 
 
371 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  53.33 
 
 
390 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  54.04 
 
 
372 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
372 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  53.61 
 
 
376 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  54.04 
 
 
377 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  56.39 
 
 
371 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  55 
 
 
373 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
371 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  50.84 
 
 
371 aa  364  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  51.39 
 
 
374 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  56.39 
 
 
378 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  52.22 
 
 
366 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  53.89 
 
 
372 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  53.61 
 
 
371 aa  362  6e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  51.55 
 
 
367 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  51.14 
 
 
371 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  53.78 
 
 
377 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  51.13 
 
 
379 aa  358  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  51.12 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  56.58 
 
 
373 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  48.61 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  56.86 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  54.85 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  50.56 
 
 
373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  55.56 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  49.3 
 
 
367 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  54.08 
 
 
373 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  52.22 
 
 
372 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  57.54 
 
 
368 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  50.56 
 
 
370 aa  353  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  52.53 
 
 
372 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  54.44 
 
 
371 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  51.85 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  50.56 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  54.21 
 
 
376 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  54.44 
 
 
371 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  54.7 
 
 
370 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  52.51 
 
 
371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  52.76 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  56.3 
 
 
373 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  55.31 
 
 
368 aa  351  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  54.21 
 
 
374 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  53.5 
 
 
371 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  56.3 
 
 
373 aa  349  5e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  52.44 
 
 
372 aa  348  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  54.13 
 
 
370 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  56.11 
 
 
372 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  53.99 
 
 
372 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>