More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0465 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 406 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  46.65 
 
 		 408 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  48.58 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  49.06 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  47.68 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  47.94 
 
 		 411 aa  363  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  47.99 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  46.91 
 
 		 403 aa  358  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  46.13 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  44.19 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  44.25 
 
 		 406 aa  355  8.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  44.17 
 
 		 408 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  45.95 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.73 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  42.82 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  45.04 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  43.16 
 
 		 373 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  42.15 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  42.78 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.9 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  42.63 
 
 		 377 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  39.78 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  42.66 
 
 		 366 aa  300  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  41.82 
 
 		 377 aa  298  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  44.74 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  43.8 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  43.8 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  43.8 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  46.15 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  43.8 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 372 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  42.09 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  42.42 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  41.14 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  41.55 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  42.98 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  40.05 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  41.55 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  42.98 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  42.7 
 
 		 371 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  42.32 
 
 		 376 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  42.98 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  42.74 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  44.65 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  38.89 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  42.43 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 371 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 371 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  42.98 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  42.55 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  42.31 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  44.39 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  39.95 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  43.6 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  44.39 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  43.67 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  43.96 
 
 		 377 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  44.63 
 
 		 373 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  42.66 
 
 		 363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  39.19 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  42.66 
 
 		 363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  41.89 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  42.74 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  43.51 
 
 		 371 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  41.03 
 
 		 371 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  41.27 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  45.33 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  38.92 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  40.64 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  42.97 
 
 		 371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  42.74 
 
 		 373 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  40.5 
 
 		 370 aa  282  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  44.5 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  41.08 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  41.08 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  43.43 
 
 		 371 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  45.33 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  42.32 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  44.02 
 
 		 373 aa  279  7e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  43.75 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  43.13 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>