242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0788 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  100 
 
 		 390 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 390 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  99.23 
 
 		 390 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.18 
 
 		 390 aa  569  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.35 
 
 		 390 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  65 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.31 
 
 		 386 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  65.78 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  64.51 
 
 		 403 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  61.27 
 
 		 380 aa  461  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  60 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.97 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  27.47 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  27.44 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  24.94 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  23.15 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  25.19 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  24.66 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  23.4 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  25.51 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  25.55 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  26.06 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  25.54 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  26.69 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.17 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  24.55 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  25.68 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  24.77 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  25.74 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  24.23 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  24.62 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  23.65 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  25.3 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  23.47 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  24.34 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  23.48 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  23.72 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  22.33 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  22.86 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  22.33 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  24.06 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  23.5 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  24.26 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  23.67 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  23.67 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  23.67 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  23.24 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  24.07 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  24.48 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  23.66 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  26.63 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  22.76 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  25.1 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  22.1 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  23.7 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  24.59 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  33.59 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  29.69 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  24.59 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  25.84 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  22.16 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  25.29 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  22.42 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  22.68 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  24.12 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  23.7 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  23.44 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  23.44 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  25.97 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  24.55 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  23.1 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  24.43 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  25.51 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  24.29 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  24.33 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  26.12 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25.14 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  23.55 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  24.48 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  23.15 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  24.73 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  26.84 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  21.86 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  23.99 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>