217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 410 aa  832    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.63 
 
 		 386 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  63.09 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  62.03 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  60.36 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  60 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  55.44 
 
 		 380 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.68 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.49 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.29 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  27.51 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  26.04 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  25.38 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  24.66 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  25.16 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  23.12 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  24.26 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  25.53 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  26.09 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  25.47 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  23.34 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  27.24 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  25.88 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  24.91 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  22.6 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  24.91 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  25.85 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  24.5 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  29.08 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  24.52 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  24.2 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  24.13 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  24.37 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  30.3 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  23.61 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  24.82 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  27.7 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  25.09 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  30.6 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  25.41 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  30.08 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  26.16 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  23.91 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  29.85 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  22.61 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  22.92 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  24.16 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  24.48 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.76 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  23.36 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  24.26 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  24.03 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  24.52 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  22.96 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  30.63 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  23.9 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  22.28 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  23.93 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25.71 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  24.21 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  22.26 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  24.26 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  30.77 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  36.36 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  22.45 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  30 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  23.32 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  24.76 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  24.24 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  36.36 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  23.2 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  23.61 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  22.09 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  24.18 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  22.55 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2063  alanine dehydrogenase  20.33 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  22.55 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  26.37 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  29.29 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  35.9 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  24.19 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1134  alanine dehydrogenase  24.36 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  21.81 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  22.64 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  21.3 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  22.19 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  23.62 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  25.59 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  25.59 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  23.03 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  23.1 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  38.03 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  41.54 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  23.26 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  22.56 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  21.98 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>