266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3668 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 392 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  83.25 
 
 		 386 aa  675    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  70.05 
 
 		 387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  66.58 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  65 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.26 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.74 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  62.03 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.53 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  60.21 
 
 		 380 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.91 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  27.43 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  26.84 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  28.17 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  25.36 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  24.7 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  27.85 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  26.97 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  23.97 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  26.32 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  27.52 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  23.82 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  27.52 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  24.93 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  25.97 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  24.58 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  26.73 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  25.53 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  25.53 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  26.63 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  25.53 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  26.18 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  26.57 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  25.53 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  24.25 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  24.47 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  26.67 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  24.63 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  25.33 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  23.78 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  25.75 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  23.78 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  25.33 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  23.66 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  25.3 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  26.96 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  25.33 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  25.84 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  24.39 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  25.14 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  24.64 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  24.8 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  22.89 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  26.58 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  25.2 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  23.99 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  23.5 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  24.17 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  26.16 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  26.32 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  25.94 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  25.4 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  28.62 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  25 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  25.53 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  24.7 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  24.85 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  25.87 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  27.02 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  22.1 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  24.59 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  25.17 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  24.12 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  22.95 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  24.55 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  27.41 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  25.16 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  26.72 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  25.97 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  25.38 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  26.19 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  23.17 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  24.1 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  26.06 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  24.53 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25.07 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  24.05 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  27.13 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  25.76 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  25.75 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  24.32 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  22.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>