240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0784 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  99.23 
 
 
390 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  99.23 
 
 
390 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
390 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.66 
 
 
390 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.09 
 
 
390 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  65.26 
 
 
392 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.58 
 
 
386 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  65.78 
 
 
387 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  64.51 
 
 
403 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  61.54 
 
 
380 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  60 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.97 
 
 
382 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  27.47 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  24.94 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  23.44 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  27.13 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  23.28 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  24.48 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  26.29 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  24.39 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  25.27 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  25.78 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  25.68 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  24.55 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  25.3 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  24.66 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  24.77 
 
 
323 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  26.18 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  24.62 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  23.47 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  23.67 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  23.67 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  24.23 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  24.34 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  23.67 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  25.44 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  23.24 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  24.83 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  22.86 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  23.22 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  24.26 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  23.35 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  25.75 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  23.5 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  23.42 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  22.01 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  23.77 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  22.01 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  24.48 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  23.81 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  24.28 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  22.16 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  24.59 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  22.76 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  24.59 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  22.1 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  24.32 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  25.29 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  24.12 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  23.1 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  23.19 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  25.97 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  24.33 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  23.41 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  22.68 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  24.32 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  25.53 
 
 
374 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  24.12 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  23.7 
 
 
371 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  24.19 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  23.32 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  22.42 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25.14 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  26.12 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  23.55 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  23.44 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  23.44 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  23.56 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 
371 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  32.82 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  28.91 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  22.88 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  25.44 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  25 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  31.45 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  24.48 
 
 
371 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>