More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0563 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 366 aa  736    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  52.19 
 
 		 373 aa  360  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  52.33 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  52.96 
 
 		 377 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  344  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  52.43 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  49.45 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  48.79 
 
 		 371 aa  338  9e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.78 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  56.82 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  52.05 
 
 		 371 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 377 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  48.63 
 
 		 377 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  48.91 
 
 		 377 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  49.17 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  49.17 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  57.1 
 
 		 368 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  49.16 
 
 		 372 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  49.16 
 
 		 372 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  50.54 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  52.46 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  48.63 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  55.46 
 
 		 368 aa  326  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  50.96 
 
 		 371 aa  325  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  51.09 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  54.17 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  48.07 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  48.76 
 
 		 376 aa  322  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  54.52 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 365 aa  315  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  53.66 
 
 		 365 aa  315  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  51.68 
 
 		 376 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  48.07 
 
 		 372 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  47.85 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  51.25 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  50 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  53.69 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  49.17 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  53.87 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  51.39 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  52.86 
 
 		 380 aa  312  6.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  49.04 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  50.43 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  52.75 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  50.28 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  49.45 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  51.1 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  47.88 
 
 		 371 aa  309  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  47.35 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  48.04 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  50.83 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  49.59 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 		 366 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  47.28 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  49.59 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  53.98 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  50.85 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  48.62 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  51.54 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  49.46 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  51.48 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  51.11 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 371 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  49.3 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  48.9 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  46.47 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  52.38 
 
 		 376 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  52.55 
 
 		 376 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  47.92 
 
 		 376 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1654  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 		 367 aa  295  7e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  47.67 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  52.49 
 
 		 371 aa  295  9e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  51.93 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  53.41 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  48.49 
 
 		 371 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>