216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1044 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
390 aa  795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  83.33 
 
 
390 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  73.18 
 
 
390 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.18 
 
 
390 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.66 
 
 
390 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  64.74 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.83 
 
 
386 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  62.34 
 
 
387 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  62.24 
 
 
403 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  60.37 
 
 
380 aa  455  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  56.68 
 
 
410 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.88 
 
 
382 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  25.41 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.22 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  26.71 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  23.39 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  26.11 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  24.18 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  22.87 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  23.08 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  23.67 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.73 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  24.13 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  23.92 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  24.25 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  26.92 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  22.63 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  22.37 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  25.88 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  23.84 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  22.34 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  24.25 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  24.7 
 
 
371 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  22.76 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  36.8 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  25.44 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  25.73 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  26.23 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  24.16 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  25.96 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  23.48 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  26.33 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  23.96 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.41 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  24.15 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  26.65 
 
 
363 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.56 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  26.05 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  23.4 
 
 
370 aa  60.1  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  23.5 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  24.37 
 
 
372 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  24.77 
 
 
370 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  24.8 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.08 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  21.75 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  24.77 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  26.04 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  26.21 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  26.04 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  23.1 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  23.56 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  24.91 
 
 
371 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  25.6 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  25.67 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  26.2 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  23.81 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  21.72 
 
 
371 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  25.14 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  21.72 
 
 
371 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  23.42 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  24.24 
 
 
370 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  23.88 
 
 
399 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  24.11 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  24.39 
 
 
371 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  23.69 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  23.33 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  23.37 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2995  alanine dehydrogenase  24.78 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  24.11 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  25.08 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  23.87 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  22.82 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  22.45 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  26.82 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  22.75 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  21.45 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  23.71 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  23.51 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  25.63 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>