More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0346 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 		 357 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  62.04 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  49.44 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  49.44 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  45.79 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  47.08 
 
 		 390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  9e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  45.75 
 
 		 372 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 373 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 377 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  43.85 
 
 		 372 aa  315  9e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  43.73 
 
 		 376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  43.61 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  44.85 
 
 		 377 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  48.31 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  45.86 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  45.15 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  42.82 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  47.08 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  45.96 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  44.57 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  48.56 
 
 		 372 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  45.25 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  43.89 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  47.74 
 
 		 371 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  44.01 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  45.98 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  44.01 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  43.33 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  46.39 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  43.77 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  44.97 
 
 		 373 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  45.68 
 
 		 370 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 371 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  45.68 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  44.01 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  42.27 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  43.21 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  43.21 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  43.21 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  45.4 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  44.72 
 
 		 372 aa  298  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  42.5 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  42.78 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  44.85 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  44.57 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  46.93 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  44.96 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  45.68 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  41.16 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  40.67 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  41.55 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  44.01 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  43.45 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5339  alanine dehydrogenase  49.03 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  43.45 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  47.09 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  43.18 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  45.98 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  44.04 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  41.34 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  43.89 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 374 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  45.86 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>