More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3004 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 368 aa  735    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  63.03 
 
 		 365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  63.59 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  60.78 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 374 aa  345  8.999999999999999e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  48.32 
 
 		 371 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  50.28 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  50.7 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  48.31 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 373 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  47.63 
 
 		 371 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  49.3 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  52.78 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  48.6 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  52.78 
 
 		 370 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  47.47 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  53.06 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  46.52 
 
 		 371 aa  332  6e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  46.52 
 
 		 377 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  48.28 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  47.83 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  49 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  46.96 
 
 		 376 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  50.56 
 
 		 370 aa  328  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  48.06 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  47.08 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  47.08 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  48.29 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  46.67 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  47.08 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  46.11 
 
 		 371 aa  326  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  46.8 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  46.72 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  50.86 
 
 		 376 aa  325  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  47.01 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  47.08 
 
 		 371 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  52.56 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  48.15 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  47.08 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  51.14 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  47.35 
 
 		 369 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  46.94 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  48.07 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  49.16 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  46.67 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  47.47 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  45.36 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  48.87 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  47.89 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  47.89 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  48.86 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  44.66 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  47.91 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  49.71 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  48.88 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  47.35 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  46.87 
 
 		 371 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  45.81 
 
 		 372 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  47.63 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  47.22 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  48.3 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  50.7 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  44.38 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  50.29 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  49.44 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  45.4 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  43.98 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  45.68 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  49.14 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  48.47 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  43.54 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 371 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  45.13 
 
 		 371 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0723  L-alanine dehydrogenase  51.99 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 376 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  44.85 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>