296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  790    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.2 
 
 		 386 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  70.05 
 
 		 392 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  67.2 
 
 		 403 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.78 
 
 		 390 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  65.78 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.78 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  63.09 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.34 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.02 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  61.27 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.07 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  27.47 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  27.49 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  29 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  25.48 
 
 		 366 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  24.68 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  25.98 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  25.43 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  28.18 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  27.64 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  27.78 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  26.22 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  25.41 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  25.41 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  26.69 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  27.86 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  25.73 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  27.03 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  26.5 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  26.79 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  25.16 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  26.86 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  26.49 
 
 		 370 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  26.19 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  27.94 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  27.05 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  23.78 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  26.92 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  24.77 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  25.15 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  25.15 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  26.96 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  25.15 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  25.37 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  24.3 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  25.65 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  25.44 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  24.85 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  24.14 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  24.17 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  24.85 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  24.23 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.17 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1729  alanine dehydrogenase  24.73 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144319  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  24.85 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  25.83 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  25.67 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  25.14 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  22.96 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  24.08 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  24.08 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  25.66 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  24.47 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  23.71 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  23.14 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0244  alanine dehydrogenase  26.32 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  25.64 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  27 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  25.9 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  24.19 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  25.29 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  25.45 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  23.94 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1134  alanine dehydrogenase  23.7 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  25.72 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  24.25 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  26.67 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  25.86 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  25.82 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  23.19 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  24.53 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  24.18 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  24.04 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  24.56 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>