240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3833 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3833  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
382 aa  792    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507137  normal  0.206016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  47.07 
 
 
387 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.38 
 
 
386 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  45.91 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7427  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  46.19 
 
 
403 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.97 
 
 
390 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  44.97 
 
 
390 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.97 
 
 
390 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22750  alanine dehydrogenase  45.29 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5627  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.95 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.88 
 
 
390 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5223  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.41 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  24.43 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  21.98 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  23.67 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  24.52 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  22.73 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  21.67 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  21.64 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  21.79 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  21.9 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  21.95 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  21.49 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  23.74 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  22.81 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  22.93 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  21.32 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  21.51 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  21.83 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  22.19 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  21.98 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  21.98 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  21.98 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  23.71 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  22.51 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  23.39 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  24.2 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  22.46 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  21.21 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  21.47 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0698  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  21.99 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.740093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  21.37 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  21.54 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  20.97 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  21.3 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  23.18 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  20.13 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1528  alanine dehydrogenase  20.53 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  21.62 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1499  alanine dehydrogenase  20.53 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  21.47 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  23.32 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  21.62 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3803  alanine dehydrogenase  22.58 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  20.57 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  22.04 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  22.37 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  22.31 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.36 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  20.59 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  21.25 
 
 
355 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  23.63 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  20.79 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1744  L-alanine dehydrogenase  23.26 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00361156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4012  L-alanine dehydrogenase  23.63 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  22.68 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  21.53 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  20.59 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  21.2 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  21.91 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  31.63 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  20.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03060  L-alanine dehydrogenase  22.19 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  20.93 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  20.27 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  21.14 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.89 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  22.07 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  21.98 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  19.79 
 
 
377 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  20.47 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  20.11 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  22.1 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  20.27 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  21.68 
 
 
341 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  21.49 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.48 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  21.67 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  23.2 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  22.09 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  22.74 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>